Bancos de Dados de Sequências Genômicas

COGs – Classificação filogenética de proteínas codificadas em genomas completos baseada em comparação de sequências proteicas

DDBJ – Banco de dados de sequências de nucleotídeos e suas descrições biológicas

DEG – DEG abriga dados de genes essenciais atualmente avaliáveis dentre uma grande quantidade de organismos

EMBL – Banco de dados de sequências de nucleotídeos pruzido por uma colaboração internacional entre GenBank e DDBJ

GenBank – O banco de dados de sequências genéticas dos institutos estadounidenses de saúde, uma coleção comentada de todas as publicações com sequências de DNA disponíveis

KEGG – Um banco de dados abrangente de sistemas biológicos, incluindo genes, enzimas, metabólitos, reações e vias metabólicas

MaGe – Sistema de anotação sobre genomas microbianos

TIGR – Banco de dados do Instrituto J. Craig Venter

Plasmid Databases: Links de várias fontes de sequências de plasmídeos

Bancos de Dados de Proteínas, Enzimas e Expressão Gênica

BRENDA: Um sistema de informação de enzimas abrangente

ExPASy: Análise de sequências de proteínas e estruturas

GEO: Uma curadoria online de fontes para expressão gênica

InterPro: InterPro é o database de famílias de proteínas, domínios, regiões, repetições e sítios em que características identificáveis encontradas em proteínas conhecidas podem ser aplicadas à novas sequências proteicas

PANTHER: Uma fonte única que classifica genes por suas funções, usando experiências científicas publicadas e relações evolutivas para predizer a função mesmo na ausência de evidência experimental direta

Pfam: O banco de dados Pfam é uma larga coleção de famílias de proteínas, cada uma representada por uma sequência múltipla de alinhamentos de sequências e Modelos Ocultos de Markov (HMM em inglês)

TCDB: Um abrangente sistema de classificação aprovado pela UIBMB (União internacional de Bioquímica e Biologia Molecular) para proteínas de transporte em membranas, conhecido como o sistema de Classificação do Transportador (tradução livre)

TransportDB: Um database abrangente sobre informações de transportadores da membrana citoplasmática e canais de membranas externas em organismos que as sequências completas do genoma estão avaliáveis